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Stereo-seq芯片上布滿了數十億規則陣列排布的單鏈線球狀 DNA 納米球(DNA NanoBall,DNB)。DNB 是以單鏈環狀DNA 為模板、經過滾環擴增(Rolling-Circle Replication,RCR)后得到的產物，每個 DNB 直徑為 220 nm，兩個 DNB中心點間距范圍為 500 nm。攜帶空間條形碼(Coordinate lD，CID)的DNB鏈接分子編碼 (Molecular ID,MID)和PolyT后，可以實現游離 mRNA和蛋白抗體上的ADT分子的捕獲。通過測序得到CID 信息，CID 和DNB 坐標位置一一對應。建立CID 與坐標位置的映射關系后，實現mRNA 和ADT 空間位置的還原。